Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 AC110921.1-201ENST00000577544 612 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 METTL23-207ENST00000588783 1184 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 LRRIQ3-203ENST00000370911 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 C20orf85-201ENST00000371168 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 IL20RB-AS1-201ENST00000462176 562 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAMK2BQ13554 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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