Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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