Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL16A1Q07092 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL16A1Q07092 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL16A1Q07092 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL16A1Q07092 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL16A1Q07092 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL16A1Q07092 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL16A1Q07092 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL16A1Q07092 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
COL16A1Q07092 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
COL16A1Q07092 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL16A1Q07092 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL16A1Q07092 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL16A1Q07092 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL16A1Q07092 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL16A1Q07092 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL16A1Q07092 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL16A1Q07092 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL16A1Q07092 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL16A1Q07092 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL16A1Q07092 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL16A1Q07092 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL16A1Q07092 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL16A1Q07092 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL16A1Q07092 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL16A1Q07092 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL16A1Q07092 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL16A1Q07092 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL16A1Q07092 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL16A1Q07092 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL16A1Q07092 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL16A1Q07092 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL16A1Q07092 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL16A1Q07092 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL16A1Q07092 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL16A1Q07092 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL16A1Q07092 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL16A1Q07092 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COL16A1Q07092 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL16A1Q07092 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL16A1Q07092 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COL16A1Q07092 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL16A1Q07092 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL16A1Q07092 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL16A1Q07092 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL16A1Q07092 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL16A1Q07092 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL16A1Q07092 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL16A1Q07092 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms