Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD51Q06609 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD51Q06609 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD51Q06609 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD51Q06609 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD51Q06609 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD51Q06609 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD51Q06609 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD51Q06609 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD51Q06609 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD51Q06609 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD51Q06609 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD51Q06609 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD51Q06609 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD51Q06609 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD51Q06609 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD51Q06609 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD51Q06609 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD51Q06609 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD51Q06609 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD51Q06609 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD51Q06609 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD51Q06609 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD51Q06609 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD51Q06609 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD51Q06609 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD51Q06609 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD51Q06609 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD51Q06609 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD51Q06609 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD51Q06609 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD51Q06609 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD51Q06609 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD51Q06609 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD51Q06609 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD51Q06609 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD51Q06609 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD51Q06609 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD51Q06609 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD51Q06609 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD51Q06609 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms