Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms