Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms