Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms