Protein–RNA interactions for Protein: Q02252

ALDH6A1, Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH6A1Q02252 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALDH6A1Q02252 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALDH6A1Q02252 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms