Protein–RNA interactions for Protein: Q01201

RELB, Transcription factor RelB, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELBQ01201 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RELBQ01201 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RELBQ01201 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RELBQ01201 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RELBQ01201 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RELBQ01201 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RELBQ01201 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RELBQ01201 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RELBQ01201 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RELBQ01201 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RELBQ01201 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RELBQ01201 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RELBQ01201 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RELBQ01201 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RELBQ01201 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RELBQ01201 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RELBQ01201 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RELBQ01201 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RELBQ01201 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RELBQ01201 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RELBQ01201 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RELBQ01201 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RELBQ01201 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RELBQ01201 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RELBQ01201 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RELBQ01201 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RELBQ01201 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RELBQ01201 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RELBQ01201 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RELBQ01201 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RELBQ01201 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RELBQ01201 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RELBQ01201 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RELBQ01201 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RELBQ01201 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RELBQ01201 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RELBQ01201 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RELBQ01201 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RELBQ01201 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RELBQ01201 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RELBQ01201 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RELBQ01201 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RELBQ01201 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RELBQ01201 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RELBQ01201 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RELBQ01201 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RELBQ01201 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RELBQ01201 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RELBQ01201 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RELBQ01201 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RELBQ01201 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RELBQ01201 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RELBQ01201 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RELBQ01201 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RELBQ01201 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RELBQ01201 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RELBQ01201 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RELBQ01201 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RELBQ01201 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RELBQ01201 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RELBQ01201 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RELBQ01201 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RELBQ01201 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RELBQ01201 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RELBQ01201 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RELBQ01201 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RELBQ01201 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RELBQ01201 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RELBQ01201 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RELBQ01201 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RELBQ01201 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RELBQ01201 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RELBQ01201 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RELBQ01201 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RELBQ01201 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RELBQ01201 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RELBQ01201 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RELBQ01201 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RELBQ01201 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RELBQ01201 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RELBQ01201 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RELBQ01201 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RELBQ01201 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RELBQ01201 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RELBQ01201 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RELBQ01201 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RELBQ01201 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RELBQ01201 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RELBQ01201 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RELBQ01201 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RELBQ01201 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RELBQ01201 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RELBQ01201 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RELBQ01201 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RELBQ01201 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RELBQ01201 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RELBQ01201 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RELBQ01201 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RELBQ01201 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RELBQ01201 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms