Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms