Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKL1Q00532 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms