Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP1P63208 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP1P63208 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP1P63208 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP1P63208 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP1P63208 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP1P63208 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP1P63208 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP1P63208 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP1P63208 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP1P63208 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP1P63208 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP1P63208 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP1P63208 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP1P63208 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP1P63208 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP1P63208 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP1P63208 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP1P63208 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP1P63208 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP1P63208 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP1P63208 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP1P63208 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP1P63208 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP1P63208 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP1P63208 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP1P63208 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP1P63208 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP1P63208 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP1P63208 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP1P63208 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP1P63208 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP1P63208 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP1P63208 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP1P63208 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP1P63208 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP1P63208 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP1P63208 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP1P63208 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP1P63208 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP1P63208 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP1P63208 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP1P63208 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP1P63208 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP1P63208 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP1P63208 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP1P63208 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP1P63208 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP1P63208 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP1P63208 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP1P63208 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP1P63208 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP1P63208 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP1P63208 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP1P63208 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP1P63208 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP1P63208 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP1P63208 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP1P63208 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP1P63208 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP1P63208 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP1P63208 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP1P63208 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP1P63208 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP1P63208 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP1P63208 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP1P63208 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP1P63208 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP1P63208 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP1P63208 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP1P63208 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP1P63208 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP1P63208 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP1P63208 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP1P63208 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP1P63208 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP1P63208 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP1P63208 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP1P63208 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP1P63208 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP1P63208 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP1P63208 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SKP1P63208 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SKP1P63208 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP1P63208 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP1P63208 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP1P63208 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP1P63208 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP1P63208 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP1P63208 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP1P63208 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP1P63208 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP1P63208 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP1P63208 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP1P63208 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP1P63208 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP1P63208 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP1P63208 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP1P63208 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKP1P63208 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms