Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CABP4P57796 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CABP4P57796 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CABP4P57796 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CABP4P57796 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CABP4P57796 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CABP4P57796 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CABP4P57796 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CABP4P57796 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CABP4P57796 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CABP4P57796 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CABP4P57796 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CABP4P57796 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CABP4P57796 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CABP4P57796 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CABP4P57796 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CABP4P57796 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP4P57796 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP4P57796 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP4P57796 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP4P57796 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP4P57796 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP4P57796 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP4P57796 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP4P57796 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP4P57796 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP4P57796 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP4P57796 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP4P57796 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP4P57796 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP4P57796 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP4P57796 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP4P57796 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP4P57796 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP4P57796 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP4P57796 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP4P57796 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP4P57796 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP4P57796 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP4P57796 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP4P57796 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP4P57796 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP4P57796 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP4P57796 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP4P57796 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CABP4P57796 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CABP4P57796 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CABP4P57796 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CABP4P57796 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CABP4P57796 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CABP4P57796 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CABP4P57796 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CABP4P57796 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CABP4P57796 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CABP4P57796 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CABP4P57796 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CABP4P57796 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CABP4P57796 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CABP4P57796 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CABP4P57796 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CABP4P57796 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CABP4P57796 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CABP4P57796 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CABP4P57796 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CABP4P57796 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CABP4P57796 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CABP4P57796 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CABP4P57796 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CABP4P57796 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CABP4P57796 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CABP4P57796 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CABP4P57796 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CABP4P57796 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CABP4P57796 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CABP4P57796 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CABP4P57796 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CABP4P57796 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CABP4P57796 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CABP4P57796 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CABP4P57796 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CABP4P57796 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CABP4P57796 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CABP4P57796 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CABP4P57796 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CABP4P57796 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CABP4P57796 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CABP4P57796 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CABP4P57796 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CABP4P57796 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CABP4P57796 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CABP4P57796 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CABP4P57796 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CABP4P57796 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CABP4P57796 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CABP4P57796 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CABP4P57796 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CABP4P57796 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CABP4P57796 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CABP4P57796 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CABP4P57796 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms