Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23BP54727 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms