Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA4P48058 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms