Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XCR1P46094 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XCR1P46094 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XCR1P46094 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XCR1P46094 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XCR1P46094 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XCR1P46094 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XCR1P46094 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XCR1P46094 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
XCR1P46094 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XCR1P46094 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
XCR1P46094 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XCR1P46094 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XCR1P46094 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XCR1P46094 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XCR1P46094 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XCR1P46094 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XCR1P46094 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XCR1P46094 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XCR1P46094 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XCR1P46094 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XCR1P46094 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XCR1P46094 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XCR1P46094 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XCR1P46094 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XCR1P46094 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XCR1P46094 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XCR1P46094 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XCR1P46094 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
XCR1P46094 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XCR1P46094 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XCR1P46094 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XCR1P46094 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XCR1P46094 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XCR1P46094 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XCR1P46094 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XCR1P46094 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XCR1P46094 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XCR1P46094 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XCR1P46094 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XCR1P46094 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XCR1P46094 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XCR1P46094 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
XCR1P46094 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XCR1P46094 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XCR1P46094 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XCR1P46094 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XCR1P46094 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XCR1P46094 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
XCR1P46094 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XCR1P46094 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XCR1P46094 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XCR1P46094 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XCR1P46094 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XCR1P46094 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XCR1P46094 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XCR1P46094 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XCR1P46094 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XCR1P46094 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XCR1P46094 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCR1P46094 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCR1P46094 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
XCR1P46094 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCR1P46094 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCR1P46094 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCR1P46094 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCR1P46094 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCR1P46094 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCR1P46094 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCR1P46094 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCR1P46094 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCR1P46094 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
XCR1P46094 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCR1P46094 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCR1P46094 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCR1P46094 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCR1P46094 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCR1P46094 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCR1P46094 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCR1P46094 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCR1P46094 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCR1P46094 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCR1P46094 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
XCR1P46094 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCR1P46094 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCR1P46094 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCR1P46094 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCR1P46094 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCR1P46094 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCR1P46094 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCR1P46094 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCR1P46094 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCR1P46094 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCR1P46094 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCR1P46094 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCR1P46094 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCR1P46094 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCR1P46094 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCR1P46094 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCR1P46094 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms