Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD52P43351 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD52P43351 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD52P43351 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD52P43351 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD52P43351 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD52P43351 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD52P43351 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD52P43351 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD52P43351 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD52P43351 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD52P43351 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD52P43351 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD52P43351 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD52P43351 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD52P43351 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD52P43351 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD52P43351 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD52P43351 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD52P43351 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD52P43351 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD52P43351 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD52P43351 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD52P43351 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD52P43351 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD52P43351 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD52P43351 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD52P43351 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD52P43351 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD52P43351 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD52P43351 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD52P43351 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD52P43351 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD52P43351 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD52P43351 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD52P43351 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD52P43351 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD52P43351 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD52P43351 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD52P43351 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD52P43351 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD52P43351 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD52P43351 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD52P43351 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD52P43351 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD52P43351 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD52P43351 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD52P43351 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD52P43351 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD52P43351 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD52P43351 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD52P43351 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD52P43351 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD52P43351 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD52P43351 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD52P43351 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD52P43351 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD52P43351 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD52P43351 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD52P43351 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD52P43351 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD52P43351 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD52P43351 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD52P43351 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD52P43351 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD52P43351 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD52P43351 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD52P43351 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD52P43351 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD52P43351 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD52P43351 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD52P43351 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD52P43351 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD52P43351 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD52P43351 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD52P43351 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD52P43351 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD52P43351 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD52P43351 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD52P43351 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD52P43351 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD52P43351 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD52P43351 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD52P43351 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD52P43351 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD52P43351 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD52P43351 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD52P43351 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD52P43351 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD52P43351 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD52P43351 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD52P43351 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD52P43351 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD52P43351 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD52P43351 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD52P43351 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD52P43351 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD52P43351 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD52P43351 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD52P43351 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms