Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms