Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms