Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXA13P31271 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
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