Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GCAP28676 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCAP28676 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCAP28676 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCAP28676 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCAP28676 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCAP28676 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCAP28676 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCAP28676 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCAP28676 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCAP28676 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCAP28676 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCAP28676 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCAP28676 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GCAP28676 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCAP28676 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCAP28676 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCAP28676 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCAP28676 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCAP28676 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCAP28676 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCAP28676 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCAP28676 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCAP28676 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCAP28676 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCAP28676 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCAP28676 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCAP28676 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCAP28676 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GCAP28676 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCAP28676 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCAP28676 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCAP28676 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCAP28676 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GCAP28676 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GCAP28676 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GCAP28676 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GCAP28676 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCAP28676 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCAP28676 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCAP28676 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCAP28676 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCAP28676 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCAP28676 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCAP28676 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCAP28676 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GCAP28676 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCAP28676 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCAP28676 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCAP28676 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCAP28676 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GCAP28676 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GCAP28676 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GCAP28676 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCAP28676 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCAP28676 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCAP28676 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCAP28676 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GCAP28676 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GCAP28676 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCAP28676 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCAP28676 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCAP28676 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCAP28676 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCAP28676 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCAP28676 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCAP28676 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCAP28676 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCAP28676 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCAP28676 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCAP28676 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCAP28676 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCAP28676 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCAP28676 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCAP28676 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCAP28676 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCAP28676 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCAP28676 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCAP28676 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCAP28676 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCAP28676 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCAP28676 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCAP28676 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCAP28676 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCAP28676 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCAP28676 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GCAP28676 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCAP28676 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCAP28676 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCAP28676 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCAP28676 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCAP28676 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCAP28676 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GCAP28676 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCAP28676 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCAP28676 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCAP28676 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCAP28676 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCAP28676 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCAP28676 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms