Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTGS1P23219 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms