Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms