Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
XBP1P17861 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
XBP1P17861 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
XBP1P17861 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
XBP1P17861 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
XBP1P17861 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
XBP1P17861 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
XBP1P17861 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
XBP1P17861 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
XBP1P17861 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
XBP1P17861 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
XBP1P17861 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
XBP1P17861 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
XBP1P17861 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
XBP1P17861 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
XBP1P17861 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
XBP1P17861 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
XBP1P17861 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
XBP1P17861 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
XBP1P17861 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
XBP1P17861 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
XBP1P17861 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
XBP1P17861 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
XBP1P17861 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
XBP1P17861 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.95■□□□□ 0.79
XBP1P17861 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
XBP1P17861 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
XBP1P17861 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
XBP1P17861 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
XBP1P17861 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
XBP1P17861 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
XBP1P17861 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
XBP1P17861 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
XBP1P17861 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
XBP1P17861 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
XBP1P17861 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
XBP1P17861 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
XBP1P17861 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
XBP1P17861 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
XBP1P17861 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
XBP1P17861 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
XBP1P17861 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
XBP1P17861 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
XBP1P17861 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
XBP1P17861 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
XBP1P17861 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
XBP1P17861 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
XBP1P17861 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
XBP1P17861 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
XBP1P17861 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
XBP1P17861 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
XBP1P17861 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
XBP1P17861 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
XBP1P17861 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
XBP1P17861 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
XBP1P17861 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
XBP1P17861 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
XBP1P17861 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
XBP1P17861 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
XBP1P17861 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
XBP1P17861 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
XBP1P17861 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
XBP1P17861 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
XBP1P17861 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
XBP1P17861 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
XBP1P17861 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
XBP1P17861 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
XBP1P17861 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
XBP1P17861 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
XBP1P17861 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
XBP1P17861 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
XBP1P17861 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
XBP1P17861 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
XBP1P17861 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
XBP1P17861 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
XBP1P17861 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
XBP1P17861 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
XBP1P17861 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
XBP1P17861 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
XBP1P17861 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
XBP1P17861 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
XBP1P17861 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
XBP1P17861 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
XBP1P17861 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
XBP1P17861 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
XBP1P17861 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
XBP1P17861 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
XBP1P17861 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
XBP1P17861 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
XBP1P17861 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
XBP1P17861 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
XBP1P17861 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
XBP1P17861 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
XBP1P17861 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
XBP1P17861 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
XBP1P17861 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
XBP1P17861 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
XBP1P17861 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
XBP1P17861 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
XBP1P17861 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms