Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HPGDP15428 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HPGDP15428 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HPGDP15428 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HPGDP15428 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HPGDP15428 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HPGDP15428 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HPGDP15428 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HPGDP15428 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HPGDP15428 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
HPGDP15428 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HPGDP15428 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HPGDP15428 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPGDP15428 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPGDP15428 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPGDP15428 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPGDP15428 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPGDP15428 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPGDP15428 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPGDP15428 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HPGDP15428 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPGDP15428 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPGDP15428 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPGDP15428 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPGDP15428 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPGDP15428 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPGDP15428 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPGDP15428 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPGDP15428 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPGDP15428 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HPGDP15428 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPGDP15428 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPGDP15428 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPGDP15428 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPGDP15428 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPGDP15428 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPGDP15428 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPGDP15428 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPGDP15428 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPGDP15428 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPGDP15428 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HPGDP15428 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPGDP15428 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPGDP15428 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPGDP15428 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HPGDP15428 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPGDP15428 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPGDP15428 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPGDP15428 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPGDP15428 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPGDP15428 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPGDP15428 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPGDP15428 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPGDP15428 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPGDP15428 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPGDP15428 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPGDP15428 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPGDP15428 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPGDP15428 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HPGDP15428 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPGDP15428 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPGDP15428 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPGDP15428 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPGDP15428 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPGDP15428 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPGDP15428 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPGDP15428 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPGDP15428 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPGDP15428 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPGDP15428 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPGDP15428 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPGDP15428 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPGDP15428 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPGDP15428 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HPGDP15428 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPGDP15428 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPGDP15428 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPGDP15428 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPGDP15428 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPGDP15428 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPGDP15428 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPGDP15428 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPGDP15428 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPGDP15428 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPGDP15428 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPGDP15428 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPGDP15428 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPGDP15428 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPGDP15428 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPGDP15428 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPGDP15428 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPGDP15428 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPGDP15428 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPGDP15428 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPGDP15428 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPGDP15428 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPGDP15428 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPGDP15428 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPGDP15428 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPGDP15428 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms