Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms