Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms