Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms