Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSF2P04141 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSF2P04141 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSF2P04141 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CSF2P04141 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSF2P04141 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSF2P04141 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CSF2P04141 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CSF2P04141 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CSF2P04141 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSF2P04141 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSF2P04141 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSF2P04141 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CSF2P04141 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSF2P04141 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CSF2P04141 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSF2P04141 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CSF2P04141 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSF2P04141 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSF2P04141 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSF2P04141 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSF2P04141 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSF2P04141 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSF2P04141 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSF2P04141 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF2P04141 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF2P04141 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF2P04141 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF2P04141 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF2P04141 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF2P04141 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF2P04141 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF2P04141 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF2P04141 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF2P04141 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF2P04141 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF2P04141 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF2P04141 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF2P04141 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF2P04141 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF2P04141 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF2P04141 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF2P04141 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF2P04141 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF2P04141 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF2P04141 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF2P04141 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF2P04141 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF2P04141 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF2P04141 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF2P04141 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF2P04141 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF2P04141 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF2P04141 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF2P04141 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF2P04141 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF2P04141 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF2P04141 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF2P04141 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF2P04141 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF2P04141 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF2P04141 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF2P04141 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF2P04141 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF2P04141 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF2P04141 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF2P04141 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF2P04141 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF2P04141 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF2P04141 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF2P04141 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF2P04141 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF2P04141 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF2P04141 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF2P04141 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF2P04141 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF2P04141 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF2P04141 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF2P04141 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF2P04141 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF2P04141 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF2P04141 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF2P04141 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF2P04141 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF2P04141 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF2P04141 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF2P04141 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF2P04141 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF2P04141 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF2P04141 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF2P04141 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF2P04141 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF2P04141 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF2P04141 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF2P04141 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF2P04141 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF2P04141 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF2P04141 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF2P04141 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF2P04141 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms