Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEBLO76041 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEBLO76041 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEBLO76041 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEBLO76041 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEBLO76041 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEBLO76041 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEBLO76041 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEBLO76041 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEBLO76041 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEBLO76041 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEBLO76041 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEBLO76041 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEBLO76041 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEBLO76041 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEBLO76041 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEBLO76041 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEBLO76041 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEBLO76041 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEBLO76041 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEBLO76041 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEBLO76041 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEBLO76041 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEBLO76041 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEBLO76041 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEBLO76041 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEBLO76041 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEBLO76041 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEBLO76041 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEBLO76041 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEBLO76041 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEBLO76041 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEBLO76041 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEBLO76041 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEBLO76041 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NEBLO76041 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NEBLO76041 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NEBLO76041 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NEBLO76041 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NEBLO76041 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEBLO76041 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEBLO76041 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEBLO76041 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEBLO76041 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEBLO76041 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEBLO76041 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEBLO76041 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEBLO76041 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEBLO76041 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEBLO76041 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEBLO76041 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEBLO76041 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEBLO76041 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEBLO76041 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEBLO76041 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEBLO76041 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEBLO76041 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEBLO76041 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEBLO76041 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEBLO76041 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEBLO76041 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEBLO76041 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEBLO76041 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEBLO76041 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEBLO76041 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEBLO76041 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEBLO76041 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEBLO76041 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEBLO76041 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEBLO76041 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEBLO76041 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEBLO76041 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEBLO76041 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEBLO76041 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEBLO76041 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEBLO76041 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEBLO76041 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEBLO76041 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEBLO76041 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEBLO76041 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEBLO76041 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEBLO76041 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NEBLO76041 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEBLO76041 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEBLO76041 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEBLO76041 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEBLO76041 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEBLO76041 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEBLO76041 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEBLO76041 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEBLO76041 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEBLO76041 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEBLO76041 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEBLO76041 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEBLO76041 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEBLO76041 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEBLO76041 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEBLO76041 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEBLO76041 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEBLO76041 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms