Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSVO60911 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSVO60911 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSVO60911 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSVO60911 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSVO60911 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSVO60911 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSVO60911 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSVO60911 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSVO60911 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSVO60911 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSVO60911 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSVO60911 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSVO60911 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSVO60911 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSVO60911 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSVO60911 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSVO60911 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSVO60911 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSVO60911 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSVO60911 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSVO60911 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSVO60911 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSVO60911 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSVO60911 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSVO60911 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSVO60911 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSVO60911 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSVO60911 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSVO60911 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSVO60911 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSVO60911 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSVO60911 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSVO60911 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSVO60911 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSVO60911 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSVO60911 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSVO60911 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSVO60911 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSVO60911 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSVO60911 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSVO60911 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSVO60911 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSVO60911 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSVO60911 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSVO60911 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSVO60911 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSVO60911 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSVO60911 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSVO60911 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSVO60911 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSVO60911 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSVO60911 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSVO60911 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSVO60911 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSVO60911 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSVO60911 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSVO60911 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSVO60911 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSVO60911 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSVO60911 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSVO60911 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSVO60911 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSVO60911 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSVO60911 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSVO60911 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSVO60911 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSVO60911 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSVO60911 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSVO60911 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSVO60911 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSVO60911 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSVO60911 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSVO60911 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSVO60911 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSVO60911 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSVO60911 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSVO60911 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSVO60911 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSVO60911 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSVO60911 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSVO60911 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSVO60911 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSVO60911 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSVO60911 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSVO60911 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSVO60911 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSVO60911 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSVO60911 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSVO60911 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSVO60911 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSVO60911 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSVO60911 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSVO60911 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSVO60911 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSVO60911 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSVO60911 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSVO60911 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSVO60911 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSVO60911 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms