Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms