Protein–RNA interactions for Protein: O00233

PSMD9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD9O00233 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms