Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms