Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms