Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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