Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
KNCNA6PVL3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms