Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
STRCP1A6NGW2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
STRCP1A6NGW2 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
STRCP1A6NGW2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
STRCP1A6NGW2 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
STRCP1A6NGW2 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRCP1A6NGW2 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRCP1A6NGW2 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRCP1A6NGW2 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRCP1A6NGW2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRCP1A6NGW2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRCP1A6NGW2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRCP1A6NGW2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms