Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT87PA6NCN2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT87PA6NCN2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT87PA6NCN2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT87PA6NCN2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT87PA6NCN2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT87PA6NCN2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT87PA6NCN2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT87PA6NCN2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT87PA6NCN2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT87PA6NCN2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT87PA6NCN2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT87PA6NCN2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT87PA6NCN2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT87PA6NCN2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT87PA6NCN2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT87PA6NCN2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT87PA6NCN2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT87PA6NCN2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT87PA6NCN2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT87PA6NCN2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT87PA6NCN2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT87PA6NCN2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT87PA6NCN2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT87PA6NCN2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT87PA6NCN2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT87PA6NCN2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT87PA6NCN2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT87PA6NCN2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT87PA6NCN2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT87PA6NCN2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT87PA6NCN2 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT87PA6NCN2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT87PA6NCN2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT87PA6NCN2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT87PA6NCN2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT87PA6NCN2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT87PA6NCN2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT87PA6NCN2 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT87PA6NCN2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT87PA6NCN2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT87PA6NCN2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT87PA6NCN2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT87PA6NCN2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT87PA6NCN2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT87PA6NCN2 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT87PA6NCN2 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT87PA6NCN2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms