Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms