Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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TRAF6Q9Y4K3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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TRAF6Q9Y4K3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF6Q9Y4K3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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