Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms