Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms