Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms