Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC24A3Q9HC58 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms