Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC23

PROK2, Prokineticin-2, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROK2Q9HC23 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROK2Q9HC23 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms