Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms