Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL360268.1-201ENST00000453870 765 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC024145.1-201ENST00000535324 775 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 MGST3-214ENST00000627653 1130 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01284-201ENST00000442994 730 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001885.1-202ENST00000444002 1255 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF197-AS1-201ENST00000447691 623 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
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