Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCAPERQ9BY12 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms