Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms